Formelt sett er Nord-Norges europakontor et kommunalt oppgavefellesskap. Styreledervervet har en periode på to år og går på omgang mellom fylkesrådslederne i de to nordnorske fylkene. For inneværende periode (2023-2024) er Elin Dahlseng Eide, fylkesrådsleder i Nordland, styrets leder.

Partnerne velger en ny representant til styre hvert år og i 2023 er det Ketil Eiane, prorektor ved Nord, som er partnerrepresentant i styret. 

Se samarbeidsavtalen her.